精液中存在凝固和液化因子,精囊腺产生的凝固因子引起精液凝固,而前列腺产生的蛋白分解酶、溶纤蛋白酶等精液液化因子使精液液化。两种因子相互协调作用,维持着正常的生理功能。一旦精囊或前列腺发生了炎症,可使以上因子的分泌发生障碍,造成凝固因子增多或液化因子减少,形成精液不液化或液化迟缓。

睾酮水平不仅影响精液成分,还可改变精液凝固和液化;任何导致睾酮分泌减少及前列腺分泌功能降低的因素,都可导致精液不液化症。精索静脉曲张可使盆腔充血,使前列腺分泌液化因子减少,部分患者睾丸萎缩,睾酮分泌减少,引起液化因子减少。精索静脉曲张还可使性功能减退和内分泌功能紊乱，引起水平下降而影响附属性腺的分泌,导致精液不液化。

不液化精液中纤维蛋白原相互间网织,東缚精子,使精子活动受限,影响精子穿透宫颈黏液的能力,减缓或抑制精子进入子官腔受精,甚至使精子在运动中过多消耗能量而功能减弱或死亡。