少弱精子症病因复杂，其中70%的病人病因不明确。目前临床上检查的手段也很有限，因此医生会根据自己的经验对病情进行综合判断。目前的研究认为，与少弱精子症有明确联系的疾病包括：精索静脉曲张、隐睾、明确的生殖道感染、精子免疫性异常、性激素相关的疾病如雄激素缺乏、先天性疾病如卡尔曼综合症和克氏综合症等。如果发现其中某种疾病，那么此种疾病有可能就是少弱精子症的病因，大夫据此可以进行针对性治疗。

遗憾的是，目前就诊的病人中，能够检出明确病因的较少，我们称这一部分病人为特发性少弱精子症。目前临床上针对这一部分病人仍然以经验性治疗为主，所用的治疗方案目的在于促进睾丸的生精能力，改善精子的活力等。