1、免疫因素：
机体免疫系统有体液免疫及细胞免疫两个系统，另外还有自身免疫系统。

2、微量元素缺乏因素：
某些微量元素如锌、碘、镁、硒及铁、钙、锰的缺乏可导致一些粘膜病的发生。

3、精神因素：
一些人由于生活、工作方面的压力，或受突然出现的意外影响，心理承受过重，临床上常会导致口疮时复发，扁平苔鲜等糜烂的反复复发。

4、遗传因素：
一些口腔黏膜病与遗传因素有关，有些患者有家族史，有家族史的人群属于易感人群，当外界某些不利因素出现，会导致这类人群发病。

5、分泌因素：
机体在经历青春期、妊娠期、更年期后，进入老年阶段，体内激素及代谢等方面均发生较大变化，一些口腔粘膜也随之有一些规律性的变化，如老年性的口干平症。

6、感染因素：
很多口腔粘膜病与感染因素有关，口腔是消化道的入口，与外界相通，每天饮食都会接触大量的细菌或病毒，从口腔微生态学的角度讲，如果当机体抵抗力降低或口腔粘膜完整性受破坏时，过路菌就会停滞口腔当中，引起口腔粘膜的感染。

7、全身系统疾病及药物因素：
有些糖尿病病人；肝炎、高血压，消化道功能紊乱等疾病常伴有一些粘膜病的发生，当病人患有某些全身性疾病的时候，长期服用某种药物，其副作用会暴露出来。例如口干，或微生态失调等症状，目前这方面的研究尚缺乏系统性。